Противораковые препараты в основном вызывают у ребенка чувство усталости и потерю аппетита. Кроме того, они могут также повредить клетки сердца, почек, мочевого пузыря, легких, поджелудочной железы, эндокринных органов и нервной системы. Самыми чувствительными являются клетки крови. В течение курсов лечения у ребенка часто берется анализ крови, чтобы проконтролировать, достаточно ли количество клеток крови. По результатам анализов крови можно также оценить функционирование большинства органов. У разных детей от одного и того же препарата могут наблюдаться различные побочные действия. Химиотерапия обычно проходит циклами: 1-2 дня раз в неделю или раз в месяц 2-5-7 дней подряд. Лечение длительное, продолжаясь в среднем 1-2 года, при этом каждый ребенок болеет «своим» заболеванием и лечение для ребенка индивидуальное.

Большая часть побочных действий помаленьку пропадает, когда курс лечения закончен и у здоровых клеток появляется возможность нормально восстановиться. К счастью, большинство детей переносит курсы лечения вполне удовлетворительно.